علمی اورتحقیقی کام کرنے کے لئے ایک کتب خانہ ہے جہاں تفسیر ، حدیث، فقہ، اصول فقہ، قواعد الفقہ،سیرت وسوانح اورفن رجال وغیرہ کے مراجع ومصادر ، ادب عربی واردو اور دیگر فنون کی ایک معتد بہ تعداد میں کتابوں کا ذخیرہ موجود ہے، ان کے علاوہ کمپیوٹر بھی ہے جس میں سی ڈی کے ذریعہ المکتبۃ الشاملہ اور دیگر مکتبات کی ہزاروں کتابوں سے طلبہ استفادہ کرتے ہیں۔ چنانچہ تعلیمی اوقات کے علاوہ مغرب تا عشاء اور عشاء کے بعد دوگھنٹے کتب خانہ کھلارکھنے کا اہتمام کیا جاتاہے۔
کتب خانہ میں امارت شرعیہ، اسلامک فقہ اکیڈمی اورمسلم پرسنل لاء بورڈ کے نام سے الگ الگ گوشے بھی قائم کئے گئے ہیں جن میں ان اداروں کی مطبوعات ومتعلقات کو جمع کرنے کی کوشش کی گئی ہے تاکہ تحقیق وریسرچ کرنے والوں کے لئے آسانی ہو۔